西伯利亚蓼硫堇基因的克隆和序列分析

刘昌财1,2,刘关君1,*,刘桂丰1,李晓泽1
1 东北林业大学林学院,哈尔滨150040;2 中国人民解放军61699 部队,湖北枝江443200

通信作者:刘关君;E-mail: liuguanjun2003@126.com;Tel: 0451-82190607

摘 要:

根据西伯利亚蓼抑制消减文库(SSH)中获得的硫堇(THI)基因的部分序列,应用 RACE 技术克隆了具有 Poly A 的全 长 cDNA 序列。基因全长 789 bp,5' 非翻译区 90 bp,3' 非翻译区 276 bp,开放阅读框编码 140 个氨基酸。序列分析表 明,该编码蛋白与大多数植物 THI 蛋白前体高度相似,N 端具 24 个氨基酸的信号肽,中间 46 个氨基酸为成熟 THI 部分, C 端的 70 个氨基酸为酸性多肽部分。西伯利亚蓼 THI 蛋白与丹参等双子叶植物 THI 蛋白有较高的同源性,具保守的植物 THI 标签序列 C-C-X(5)-R-X(2)-[FY]-X(2)-C。此成熟 THI 蛋白带正电荷,偏碱性,推定可能具有抗病原微生物活性,为一 种新的植物 THI 蛋白,GenBank 登录号为 DQ981482。

关键词:西伯利亚蓼;硫堇;基因克隆;RACE

收稿:2006-08-24   修定:2006-12-26

资助:黑龙江省重点攻关项目(GB06B303)。

西伯利亚蓼硫堇基因的克隆和序列分析

刘昌财1,2,刘关君1,*,刘桂丰1,李晓泽1
1 东北林业大学林学院,哈尔滨150040;2 中国人民解放军61699 部队,湖北枝江443200

Corresponding author: ; E-mail: liuguanjun2003@126.com; Tel: 0451-82190607

Abstract:

根据西伯利亚蓼抑制消减文库(SSH)中获得的硫堇(THI)基因的部分序列,应用 RACE 技术克隆了具有 Poly A 的全 长 cDNA 序列。基因全长 789 bp,5' 非翻译区 90 bp,3' 非翻译区 276 bp,开放阅读框编码 140 个氨基酸。序列分析表 明,该编码蛋白与大多数植物 THI 蛋白前体高度相似,N 端具 24 个氨基酸的信号肽,中间 46 个氨基酸为成熟 THI 部分, C 端的 70 个氨基酸为酸性多肽部分。西伯利亚蓼 THI 蛋白与丹参等双子叶植物 THI 蛋白有较高的同源性,具保守的植物 THI 标签序列 C-C-X(5)-R-X(2)-[FY]-X(2)-C。此成熟 THI 蛋白带正电荷,偏碱性,推定可能具有抗病原微生物活性,为一 种新的植物 THI 蛋白,GenBank 登录号为 DQ981482。

Key words: 西伯利亚蓼;硫堇;基因克隆;RACE

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